隨著運行在阿里云上的 BGI Online beta 版本上線，人類距離24小時完成一個人全基因組測序和分析的夢想又邁出了堅實的一步。日前，華大基因宣布其在阿里云計算平臺部署的服務產(chǎn)品BGI Online國內(nèi)beta版本正式上線，堪稱基因行業(yè)的“應用市場”。該產(chǎn)品順利上線是繼去年10月華大基因、阿里云、英特爾在第十屆國際基因組學大會上宣布聯(lián)手啟動搭建亞太首個精準醫(yī)療開發(fā)平臺后取得的首個重要成果。這也是首個完全部署在阿里云上的大規(guī)模生物信息分析平臺。
隨著生命科學領域數(shù)據(jù)爆炸式的增長，如何及時獲取、快速分析、安全儲存這些龐大的數(shù)據(jù)是研究者們急需解決的問題。
BGI Online就是為此而生，它集成了高性能計算，大規(guī)模存儲及安全網(wǎng)絡互聯(lián)等基礎設施，支持數(shù)據(jù)的云端存儲、分析、展示和交付。用戶可以在BGI Online上訪問自己的數(shù)據(jù)，獲取標準分析結果，也可以定制個性化的數(shù)據(jù)分析方案，并與其他授權用戶分享數(shù)據(jù)和成果。
華大基因研究院院長、首席科學家徐訊表示：“BGI Online將會吸引第三方應用開發(fā)者和數(shù)據(jù)分析服務廠商，將他們的應用整合到公共平臺中，最終打造成為類似蘋果的APP Store。”
在這個“基因應用市場”中，華大基因的測序儀類似于一部智能手機，用戶可以到BGI Online“下載”各種官方或第三方應用，進一步開發(fā)自己的數(shù)據(jù)解讀和分析系統(tǒng)。BGI Online將在后續(xù)版本中引進第三方應用開發(fā)者和數(shù)據(jù)分析服務商，并將于近期召開“中國生物信息與云計算產(chǎn)業(yè)聯(lián)盟籌備暨開發(fā)者大會”與開發(fā)者共享行業(yè)發(fā)展成果。
華大基因研究院副院長、信息技術中心主任方林介紹，除了基于云端的平臺，華大基因也在開發(fā)整合硬件軟件技術的BGI Appliance一體機，通過一體機與BGI Online的互動，為用戶提供更加豐富的體驗。
值得一提的是，依托阿里云的彈性存儲和計算優(yōu)勢，BGI Online不但可以滿足基礎科研、作物育種及臨床應用等不同應用場景和模式對數(shù)據(jù)處理、存儲和傳輸?shù)男枨?，還通過使用一系列先進的數(shù)據(jù)技術，滿足HIPAA法案等行業(yè)安全條例的要求。同時，使用內(nèi)資服務器存儲和分析敏感的基因數(shù)據(jù),也更加符合我國《人類遺傳資源管理辦法》的規(guī)范。簡潔易用的界面和高度安全的特性，使醫(yī)生和研究者們可以把管理數(shù)據(jù)、硬件維護等繁雜的工作交給BGI Online和阿里云，從而更專注于他們要解決的科學和臨床問題。
這意味著，對于科研院所、醫(yī)療機構及中小型基因行業(yè)創(chuàng)業(yè)公司來說，只要擁有基因數(shù)據(jù)，不必自建和維護昂貴而復雜的計算、存儲平臺，通過BGI Online便可以解碼神秘基因背后的奧秘。全球最大的基因組學研發(fā)機構華大基因打開了基因行業(yè)這扇神秘大門，讓基因行業(yè)變得“觸手可及”。
BGI Online產(chǎn)品負責人金鑫表示，阿里云在云計算、大數(shù)據(jù)領域有豐富的經(jīng)驗和積累，能夠滿足華大基因在數(shù)據(jù)處理、隱私安全保護以及傳輸方面極為嚴苛的要求。目前華大基因在生育健康、腫瘤防治等領域的眾多分析流程已經(jīng)可以在BGI Online上運行。今后華大基因將攜手阿里云進一步開發(fā)和完善BGI Online產(chǎn)品，為全球研究者和用戶提供更便捷、更安全的服務。BGI Online團隊也將不斷引進云計算、大數(shù)據(jù)、生物信息等方面的高水平人才，不斷打磨更高質量的產(chǎn)品。
阿里云為華大基因提供了全線的云服務產(chǎn)品，并且針對BGI Online平臺特點在項目改造遷移中提供了強有力的技術支持和運維保障。阿里云高級專家孟方介紹，BGI Online平臺通過阿里云提供的混合云部署模式很好的解決了華大內(nèi)部客戶高速低延時的數(shù)據(jù)傳輸需求。通過阿里云節(jié)點提供的多線BGP接入，滿足了全球客戶高速訪問的需求。同時，低成本的數(shù)據(jù)存儲、彈性數(shù)據(jù)分析計算平臺都很好地解決了華大基因的業(yè)務需求。
BGI Online平臺的成功遷移證明了阿里云在生命科學領域的產(chǎn)品支持已經(jīng)達到世界領先水平。借助最先進的云計算技術，BGI Online使得生物信息分析和數(shù)據(jù)管理能力變得更容易獲取，極大降低了平臺用戶和華大的基因數(shù)據(jù)分析成本，為即將到來的基因大數(shù)據(jù)時代提供了高質量的基礎設施，為精準醫(yī)療、分子育種等產(chǎn)業(yè)的發(fā)展打下了堅實的基礎。
據(jù)透露，BGI Online除了針對華大基因內(nèi)部及客戶使用外，也將于近期啟動對外的免費公測服務。
“我們的目標是使用自主知識產(chǎn)權的測序儀和云端分析平臺，在24小時內(nèi)完成一個人從全基因組測序、分析到解讀的全過程。雖然面臨著不小的挑戰(zhàn)，但生命的價值值得我們?yōu)橹?。這樣的努力勢必會使中國在未來數(shù)十年在生命科學、生物產(chǎn)業(yè)獲得持續(xù)增長的強勁動力。”華大基因股份有限公司CEO尹燁說。
在阿里云計算總裁胡曉明看來，2016年視覺革命、生命科學和數(shù)據(jù)創(chuàng)業(yè)三個行業(yè)將迎來爆發(fā)性增加。他認為，2016年將是生命科學產(chǎn)業(yè)發(fā)生重大變化的一年。“基因正在和精準醫(yī)療形成交叉，人體正在變得數(shù)據(jù)化。生命科學領域數(shù)據(jù)爆炸式的增長，對海量數(shù)據(jù)的計算、存儲和分析提出新的挑戰(zhàn)。阿里云將持續(xù)創(chuàng)新，為生命科學領域提供強大的計算能力，為生命科學領域的發(fā)展發(fā)揮無法計算的價值。”胡曉明說。
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